WikiDer > NFYA

NFYA

NFYA
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNFYA, CBF-A, CBF-B, HAP2, NF-YA, субъединица фактора ядерной транскрипции Y альфа
Внешние идентификаторыOMIM: 189903 MGI: 97316 ГомолоГен: 32114 Генные карты: NFYA
Расположение гена (человек)
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человек)[1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение NFYA
Геномное расположение NFYA
Группа6п21.1Начинать41,072,945 бп[1]
Конец41,099,976 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NFYA 204107 на fs.png

PBB GE NFYA 204109 s в формате fs.png

PBB GE NFYA 204108 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_021705
NM_002505

NM_001110832
NM_010913
NM_001347401
NM_001347402

RefSeq (белок)

NP_002496
NP_068351

NP_001104302
NP_001334330
NP_001334331
NP_035043
NP_001361732

Расположение (UCSC)Chr 6: 41.07 - 41.1 МбChr 17: 48.39 - 48.41 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Субъединица фактора ядерной транскрипции Y альфа это белок что у людей кодируется NFYA ген.[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу тримерного комплекса NF-Y, образуя высококонсервативный фактор транскрипции, который связывается с мотивами CCAAT в промоторных областях в различных генах.[7] Субъединица NFYA связывается с плотным димером, состоящим из субъединиц NFYB и NFYC, в результате чего образуется тример, который связывается с ДНК с высокой специфичностью и аффинностью. Последовательно-специфические взаимодействия комплекса осуществляются субъединицей NFYA, что указывает на роль регуляторной субъединицы. Кроме того, есть доказательства посттранскрипционной регуляции этого генного продукта либо за счет деградации белка, либо за счет контроля трансляции. Дальнейшая регуляция представлена ​​альтернативным сплайсингом в богатом глутамином активационном домене с четкими тканеспецифическими предпочтениями для двух изоформ.[8]

Комплекс NF-Y служит фактор первопроходца продвигая хроматин доступность для облегчения других локализующихся факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток.[9]

NF-Y также была вовлечена как центральный игрок в транскрипция выбор стартового сайта (TSS) в животные.[10] Он защищает целостность обедненной нуклеосомой области и локализацию PIC в гене, кодирующем белок. промоутеры.

Взаимодействия

NFYA было показано взаимодействовать с Фактор ответа сыворотки[11] и ZHX1.[11][12] NFYA, NFYB и NFYC образуют комплекс NFY, и было показано, что комплекс NFY служит пионерским фактором, способствуя доступности хроматина для облегчения других ко-локализующихся факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000001167 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023994 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ли XY, Маттей М.Г., Залеска-Рутчинска З., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Фигероа Ф., Надо Дж., Бенуа С., Матис Д. (ноябрь 1991 г.). «Одна субъединица фактора транскрипции NF-Y приближается к основному комплексу гистосовместимости в мышиных и человеческих хромосомах». Геномика. 11 (3): 630–4. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90070-У. PMID 1774067.
  6. ^ Maity SN, de Crombrugghe B (май 1998 г.). «Роль CCAAT-связывающего белка CBF / NF-Y в транскрипции». Тенденции в биохимических науках. 23 (5): 174–8. Дои:10.1016 / S0968-0004 (98) 01201-8. PMID 9612081.
  7. ^ а б Олдфилд А.Дж., Ян П., Конвей А.Е., Чинху С., Фройденберг Дж.М., Йеллабойна С., Джоти Р. (сентябрь 2014 г.). «Белок гистонового складчатого домена NF-Y способствует доступности хроматина для основных факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток». Молекулярная клетка. 55 (5): 708–22. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.07.005. ЧВК 4157648. PMID 25132174.
  8. ^ «Ген Entrez: фактор ядерной транскрипции NFYA Y, альфа».
  9. ^ Олдфилд А.Дж., Ян П., Конвей А.Е., Чинху С., Фройденберг Дж.М., Йеллабойна С., Джоти Р. (сентябрь 2014 г.). «Белок гистонового складчатого домена NF-Y способствует доступности хроматина для основных факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток». Молекулярная клетка. 55 (5): 708–22. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.07.005. ЧВК 4157648. PMID 25132174.[требуется проверка]
  10. ^ Олдфилд А.Дж., Энрикес Т., Буркхолдер А.Б., Полет Д., Синху С., Ян П., Скраггс Б.С., Лаванда Калифорния, Кумар Д., Беннет Б., Соперники Е (11 июля 2019 г.). «NF-Y контролирует верность инициации транскрипции на промоторах генов путем поддержания области, лишенной нуклеосом». Nature Communications. 10 (1): 3072. Bibcode:2019NatCo..10.3072O. Дои:10.1038 / s41467-019-10905-7. ЧВК 6624317. PMID 31296853.
  11. ^ а б Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». Письма FEBS. 460 (1): 41–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01311-3. PMID 10571058. S2CID 28576187.
  12. ^ Ямада К., Принц Р.Л., Осава Х., Граннер Д.К. (август 1999 г.). «ZHX1 человека: клонирование, хромосомная локализация и взаимодействие с фактором транскрипции NF-Y». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 261 (3): 614–21. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1087. PMID 10441475.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.