WikiDer > NFYA
Субъединица фактора ядерной транскрипции Y альфа это белок что у людей кодируется NFYA ген.[5][6]
Функция
Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу тримерного комплекса NF-Y, образуя высококонсервативный фактор транскрипции, который связывается с мотивами CCAAT в промоторных областях в различных генах.[7] Субъединица NFYA связывается с плотным димером, состоящим из субъединиц NFYB и NFYC, в результате чего образуется тример, который связывается с ДНК с высокой специфичностью и аффинностью. Последовательно-специфические взаимодействия комплекса осуществляются субъединицей NFYA, что указывает на роль регуляторной субъединицы. Кроме того, есть доказательства посттранскрипционной регуляции этого генного продукта либо за счет деградации белка, либо за счет контроля трансляции. Дальнейшая регуляция представлена альтернативным сплайсингом в богатом глутамином активационном домене с четкими тканеспецифическими предпочтениями для двух изоформ.[8]
Комплекс NF-Y служит фактор первопроходца продвигая хроматин доступность для облегчения других локализующихся факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток.[9]
NF-Y также была вовлечена как центральный игрок в транскрипция выбор стартового сайта (TSS) в животные.[10] Он защищает целостность обедненной нуклеосомой области и локализацию PIC в гене, кодирующем белок. промоутеры.
Взаимодействия
NFYA было показано взаимодействовать с Фактор ответа сыворотки[11] и ZHX1.[11][12] NFYA, NFYB и NFYC образуют комплекс NFY, и было показано, что комплекс NFY служит пионерским фактором, способствуя доступности хроматина для облегчения других ко-локализующихся факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток.[7]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000001167 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023994 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Ли XY, Маттей М.Г., Залеска-Рутчинска З., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Фигероа Ф., Надо Дж., Бенуа С., Матис Д. (ноябрь 1991 г.). «Одна субъединица фактора транскрипции NF-Y приближается к основному комплексу гистосовместимости в мышиных и человеческих хромосомах». Геномика. 11 (3): 630–4. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90070-У. PMID 1774067.
- ^ Maity SN, de Crombrugghe B (май 1998 г.). «Роль CCAAT-связывающего белка CBF / NF-Y в транскрипции». Тенденции в биохимических науках. 23 (5): 174–8. Дои:10.1016 / S0968-0004 (98) 01201-8. PMID 9612081.
- ^ а б Олдфилд А.Дж., Ян П., Конвей А.Е., Чинху С., Фройденберг Дж.М., Йеллабойна С., Джоти Р. (сентябрь 2014 г.). «Белок гистонового складчатого домена NF-Y способствует доступности хроматина для основных факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток». Молекулярная клетка. 55 (5): 708–22. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.07.005. ЧВК 4157648. PMID 25132174.
- ^ «Ген Entrez: фактор ядерной транскрипции NFYA Y, альфа».
- ^ Олдфилд А.Дж., Ян П., Конвей А.Е., Чинху С., Фройденберг Дж.М., Йеллабойна С., Джоти Р. (сентябрь 2014 г.). «Белок гистонового складчатого домена NF-Y способствует доступности хроматина для основных факторов транскрипции, специфичных для определенного типа клеток». Молекулярная клетка. 55 (5): 708–22. Дои:10.1016 / j.molcel.2014.07.005. ЧВК 4157648. PMID 25132174.[требуется проверка]
- ^ Олдфилд А.Дж., Энрикес Т., Буркхолдер А.Б., Полет Д., Синху С., Ян П., Скраггс Б.С., Лаванда Калифорния, Кумар Д., Беннет Б., Соперники Е (11 июля 2019 г.). «NF-Y контролирует верность инициации транскрипции на промоторах генов путем поддержания области, лишенной нуклеосом». Nature Communications. 10 (1): 3072. Bibcode:2019NatCo..10.3072O. Дои:10.1038 / s41467-019-10905-7. ЧВК 6624317. PMID 31296853.
- ^ а б Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». Письма FEBS. 460 (1): 41–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01311-3. PMID 10571058. S2CID 28576187.
- ^ Ямада К., Принц Р.Л., Осава Х., Граннер Д.К. (август 1999 г.). «ZHX1 человека: клонирование, хромосомная локализация и взаимодействие с фактором транскрипции NF-Y». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 261 (3): 614–21. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1087. PMID 10441475.
дальнейшее чтение
- Мантовани Р. (октябрь 1999 г.). «Молекулярная биология CCAAT-связывающего фактора NF-Y». Ген. 239 (1): 15–27. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00368-6. PMID 10571030.
- Ли XY, Мантовани Р., Хоофт ван Хейсдуйнен Р., Андре I, Бенуа С., Матис Д. (март 1992 г.). «Эволюционная вариация CCAAT-связывающего фактора транскрипции NF-Y». Исследования нуклеиновых кислот. 20 (5): 1087–91. Дои:10.1093 / nar / 20.5.1087. ЧВК 312095. PMID 1549471.
- Ли XY, Хоофт ван Хейсдуйнен Р., Мантовани Р., Бенуа С., Матис Д. (май 1992 г.). «Интрон-экзонная организация генов NF-Y. Тканевый сплайсинг модифицирует домен активации». Журнал биологической химии. 267 (13): 8984–90. PMID 1577736.
- Becker DM, Fikes JD, Guarente L (март 1991 г.). «КДНК, кодирующая человеческий CCAAT-связывающий белок, клонированный посредством функциональной комплементации в дрожжах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (5): 1968–72. Bibcode:1991ПНАС ... 88.1968Б. Дои:10.1073 / пнас.88.5.1968. ЧВК 51147. PMID 2000400.
- Вуорио Т., Мэйти С.Н., де Кромбругге Б. (декабрь 1990 г.). «Очистка и молекулярное клонирование цепи« А »крысиного гетеромерного CCAAT-связывающего белка. Идентичность последовательности с фактором транскрипции HAP3 дрожжей». Журнал биологической химии. 265 (36): 22480–6. PMID 2266139.
- Мантовани Р., Ли XY, Пессара У., Хоофт ван Хуисйдуйнен Р., Бенуа С., Матис Д. (август 1994 г.). «Доминирующие отрицательные аналоги НФ-Я». Журнал биологической химии. 269 (32): 20340–6. PMID 8051128.
- Карри Р.А. (декабрь 1997 г.). «Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I (Y)». Журнал биологической химии. 272 (49): 30880–8. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30880. PMID 9388234.
- Карри Р.А. (июль 1998 г.). «Биохимическая характеристика комплекса факторов транскрипции NF-Y во время развития В-лимфоцитов». Журнал биологической химии. 273 (29): 18220–9. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18220. PMID 9660784.
- Родер К., Вольф С.С., Ларкин К.Дж., Швейцер М. (июнь 1999 г.). «Взаимодействие между двумя повсеместно экспрессируемыми факторами транскрипции NF-Y и Sp1». Ген. 234 (1): 61–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00180-8. PMID 10393239.
- Ямада К., Принц Р.Л., Осава Х., Граннер Д.К. (август 1999 г.). «ZHX1 человека: клонирование, хромосомная локализация и взаимодействие с фактором транскрипции NF-Y». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 261 (3): 614–21. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1087. PMID 10441475.
- Ямада К., Осава Х., Граннер Д.К. (октябрь 1999 г.). «Идентификация белков, взаимодействующих с NF-YA». Письма FEBS. 460 (1): 41–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01311-3. PMID 10571058. S2CID 28576187.
- Fan W, Jin S, Tong T, Zhao H, Fan F, Antinore MJ, Rajasekaran B, Wu M, Zhan Q (март 2002). «BRCA1 регулирует GADD45 посредством своего взаимодействия с мотивами OCT-1 и CAAT». Журнал биологической химии. 277 (10): 8061–7. Дои:10.1074 / jbc.M110225200. PMID 11777930.
- Faniello MC, Chirico G, Quaresima B, Cuda G, Allevato G, Bevilacqua MA, Baudi F, Colantuoni V, Cimino F, Venuta S, Avvedimento VE, Costanzo F (апрель 2002 г.). «Альтернативная модель трансактивации промотора ферритина с помощью c-Jun». Биохимический журнал. 363 (Пт 1): 53–8. Дои:10.1042/0264-6021:3630053. ЧВК 1222450. PMID 11903046.
- Bevilacqua MA, Faniello MC, Iovine B, Russo T., Cimino F, Costanzo F (ноябрь 2002 г.). «Фактор транскрипции NF-Y регулирует дифференцировку клеток CaCo-2». Архивы биохимии и биофизики. 407 (1): 39–44. Дои:10.1016 / S0003-9861 (02) 00436-8. PMID 12392713.
- Ge Y, Jensen TL, Matherly LH, Taub JW (декабрь 2002 г.). «Синергетическая регуляция промотора цистатионин-бета-синтазы-1b человека с помощью факторов транскрипции, изоформ NF-YA и Sp1». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1579 (2–3): 73–80. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00509-2. PMID 12427542.
- Сальси В., Каретти Г., Васнер М., Рейнхард В., Хаугвиц Ю., Энгеланд К., Мантовани Р. (февраль 2003 г.). «Взаимодействие между p300 и множественными тримерами NF-Y регулирует функцию промотора циклина B2». Журнал биологической химии. 278 (9): 6642–50. Дои:10.1074 / jbc.M210065200. PMID 12482752.
- Пэн Й., Джахруди Н. (март 2003 г.). «Фактор транскрипции NFY ингибирует активацию промотора фактора фон Виллебранда в неэндотелиальных клетках за счет привлечения гистондеацетилаз». Журнал биологической химии. 278 (10): 8385–94. Дои:10.1074 / jbc.M213156200. PMID 12511565.
внешняя ссылка
- NFYA + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- FactorBook NF-YA
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.
Эта статья о ген на хромосома человека 6 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |