WikiDer > IRF5

IRF5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3ДШ
Идентификаторы
Псевдонимы	IRF5, SLEB10, фактор регуляции интерферона 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 607218 MGI: 1350924 ГомолоГен: 8088 Генные карты: IRF5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	128,950,038 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	29,541,871 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • последовательное связывание ДНК; • идентичное связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • ядро клетки;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция продукции интерлейкина-12; • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь; • иммунная система; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительное регулирование выработки интерферона-альфа; • ответ на мурамилдипептид; • транскрипция, ДНК-шаблон; • защитный ответ на вирус; • сигнальный путь интерферона I типа; • ответ на пептидогликан; • положительная регуляция апоптотического процесса; • врожденная иммунная система; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительное регулирование выработки интерферона-бета; • цитокин-опосредованный сигнальный путь; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3663
	27056
	ENSG00000128604
	ENSMUSG00000029771
	Q13568
	P56477
NM_001098627; NM_001098629; NM_001098630; NM_001242452; NM_032643;
	NM_001347928; NM_001364314
	NM_001252382; NM_012057; NM_001311083
NP_001092097; NP_001092099; NP_001092100; NP_001229381; NP_116032;
	NP_001334857; NP_001351243; NP_001092099.1
	NP_001239311; NP_001298012; NP_036187
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

IRF5

Регуляторный фактор интерферона 5 это белок что у людей кодируется IRF5 ген.^[5]

Функция

IRF5 является членом регуляторный фактор интерферона (IRF) семья, группа факторы транскрипции с различными функциями, включая вирус-опосредованную активацию интерферона и модуляцию клеточного роста, дифференцировки, апоптоза и активности иммунной системы. Члены семейства IRF характеризуются консервативным N-концевой ДНК-связывающий домен содержащий триптофан (W) повторяется. Существуют альтернативные варианты сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[5]

Исследование 2020 года показало, что адаптерный белок, названный TASL, играет важную регуляторную роль в активации IRF5, фосфорилируясь по мотиву pLxIS,^[6] проводя аналогичную аналогию с IRF3 путь активации через адаптерные белки MAVS, STING и TRIF.^[7]

Клиническое значение

IRF5 действует как молекулярный переключатель, который контролирует, макрофаги будет способствовать или подавлять воспаление. Блокирование выработки IRF5 в макрофагах может помочь в лечении широкого спектра аутоиммунных заболеваний, а повышение уровня IRF5 может помочь в лечении людей, чья иммунная система ослаблена, ослаблена или повреждена. IRF5, по-видимому, работает «либо за счет прямого взаимодействия с ДНК, либо за счет взаимодействия с другими белками, которые сами контролируют, какие гены включены».^[8]

Смотрите также

Факторы регуляции интерферона

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128604 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029771 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Энтрез Ген: фактор регуляции интерферона 5 IRF5».
^ Хайнц, Леонард X .; Ли, Чан Ын; Капур, Уткарш; Картниг, Феликс; Седляров, Виталий; Папакостас, Константинос; Сезар-Разкин, Адриан; Эсслецбихлер, Патрик; Гольдманн, Ульрих; Стефанович, Адрияна; Бигензан, Йоханнес В .; Скорцони, Стефания; Pizzagalli, Mattia D .; Бенсимон, Ариэль; Мюллер, Андре С .; Кинг, Ф. Джеймс; Ли, Цзюнь; Жирарди, Энрико; Мбоу, М. Ламин; Уайтхерст, Чарльз Э .; Ребсамен, Мануэле; Суперти-Фурга, Джулио (13 мая 2020 г.). «TASL - это связанный с SLC15A4 адаптер для активации IRF5 с помощью TLR7–9». Природа. 581 (7808): 316–322. Bibcode:2020Натура.581..316H. Дои:10.1038 / s41586-020-2282-0. PMID 32433612. S2CID 218625265.
^ Лю С., Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен Х, Ли Т, Ду Ф, Рен Дж, Ву И, Гришин Н. и Чен З. Дж. (13 марта 2015 г.). «Фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF вызывает активацию IRF3». Наука. 347 (6227): ааа2630. Дои:10.1126 / science.aaa2630. PMID 25636800.
^ Краусгрубер Т., Блазек К., Смолли Т., Альзабин С., Локстон Х., Сахгал Н., Хасселл Т., Фельдманн М., Удалова И.А. (январь 2011 г.). «IRF5 способствует поляризации воспалительных макрофагов и ответов T (H) 1-T (H) 17». Нат Иммунол. 12 (3): 231–238. Дои:10.1038 / ni.1990. PMID 21240265. S2CID 13730047. Сложить резюме – MedScape.

дальнейшее чтение

Pitha PM, Au WC, Lowther W. и др. (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусной передаче сигналов и регуляции роста клеток». Биохимия. 80 (8–9): 651–8. Дои:10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2. PMID 9865487.
Барнс Б., Лубьева Б., Питха П.М. (2002). «О роли IRF в защите хозяев». J. Интерферон цитокин Res. 22 (1): 59–71. Дои:10.1089/107999002753452665. PMID 11846976.
Барнс Б.Дж., Мур PA, Pitha PM (2001). «Вирус-специфическая активация нового фактора регуляции интерферона, IRF-5, приводит к индукции различных генов интерферона альфа». J. Biol. Chem. 276 (26): 23382–90. Дои:10.1074 / jbc.M101216200. PMID 11303025.
Nehyba J, Hrdlicková R, Burnside J, Bose HR (2002). «Новый регуляторный фактор интерферона (IRF), IRF-10, играет уникальную роль в иммунной защите и индуцируется онкопротеином v-Rel». Мол. Cell. Биол. 22 (11): 3942–57. Дои:10.1128 / MCB.22.11.3942-3957.2002. ЧВК 133824. PMID 11997525.
Барнс Б.Дж., Келлум М.Дж., Field AE, Pitha PM (2002). «Множественные регуляторные домены IRF-5 контролируют активацию, клеточную локализацию и индукцию хемокинов, которые опосредуют рекрутирование Т-лимфоцитов». Мол. Cell. Биол. 22 (16): 5721–40. Дои:10.1128 / MCB.22.16.5721-5740.2002. ЧВК 133975. PMID 12138184.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Барнс Б.Дж., Филд А.Е., Пита-Роу PM (2003). «Вирус-индуцированное образование гетеродимера между IRF-5 и IRF-7 модулирует сборку энхансомов IFNA in vivo и транскрипционную активность генов IFNA». J. Biol. Chem. 278 (19): 16630–41. Дои:10.1074 / jbc.M212609200. PMID 12600985.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Bibcode:2003Наука ... 300..767С. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК 2882961. PMID 12690205.
Барнс Б.Дж., Келлум М.Дж., Пиндер К.Э. и др. (2003). «Интерферон регулирующий фактор 5, новый медиатор остановки клеточного цикла и гибели клеток». Рак Res. 63 (19): 6424–31. PMID 14559832.
Барнс Б.Дж., Ричардс Дж., Мэнкл М. и др. (2004). «Глобальные и отдельные мишени IRF-5 и IRF-7 во время врожденного ответа на вирусную инфекцию». J. Biol. Chem. 279 (43): 45194–207. Дои:10.1074 / jbc.M400726200. PMID 15308637.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Лин Р., Ян Л., Аргуэлло М. и др. (2005). «CRM1-зависимый путь ядерного экспорта участвует в регуляции субклеточной локализации IRF-5». J. Biol. Chem. 280 (4): 3088–95. Дои:10.1074 / jbc.M408452200. PMID 15556946.
Сигурдссон С., Нордмарк Г., Геринг Х. Х. и др. (2005). «Полиморфизм генов тирозинкиназы 2 и фактора регуляции интерферона 5 связан с системной красной волчанкой». Am. J. Hum. Genet. 76 (3): 528–37. Дои:10.1086/428480. ЧВК 1196404. PMID 15657875.
Такаока А., Янаи Х., Кондо С. и др. (2005). «Интегральная роль IRF-5 в программе индукции генов, активируемых Toll-подобными рецепторами». Природа. 434 (7030): 243–9. Bibcode:2005Натура.434..243Т. Дои:10.1038 / природа03308. PMID 15665823. S2CID 667829.
Schoenemeyer A, Barnes BJ, Mancl ME, et al. (2005). «Фактор регуляции интерферона, IRF5, является центральным медиатором передачи сигналов toll-подобного рецептора 7». J. Biol. Chem. 280 (17): 17005–12. Дои:10.1074 / jbc.M412584200. PMID 15695821.
Mancl ME, Hu G, Sangster-Guity N, Olshalsky SL, Hoops K, Fitzgerald-Bocarsly P, Pitha PM, Pinder K, Barnes BJ (июнь 2005 г.). «Два дискретных промотора регулируют альтернативно сплайсированные изоформы регуляторного фактора 5 человеческого интерферона. Множественные изоформы с различными типами клеток, экспрессией, локализацией, регуляцией и функцией». J. Biol. Chem. 280 (22): 21078–90. Дои:10.1074 / jbc.M500543200. PMID 15805103.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Грэм Р.Р., Козырев С.В., Бахлер Э.С. и др. (2006). «Общий гаплотип фактора регуляции интерферона 5 (IRF5) регулирует сплайсинг и экспрессию и связан с повышенным риском системной красной волчанки». Nat. Genet. 38 (5): 550–5. Дои:10.1038 / ng1782. PMID 16642019. S2CID 21426281.

внешние ссылки

IRF5 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q13568 (Регуляторный фактор интерферона 5) в PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 7 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128604 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029771 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Энтрез Ген: фактор регуляции интерферона 5 IRF5».

[6] Хайнц, Леонард X .; Ли, Чан Ын; Капур, Уткарш; Картниг, Феликс; Седляров, Виталий; Папакостас, Константинос; Сезар-Разкин, Адриан; Эсслецбихлер, Патрик; Гольдманн, Ульрих; Стефанович, Адрияна; Бигензан, Йоханнес В .; Скорцони, Стефания; Pizzagalli, Mattia D .; Бенсимон, Ариэль; Мюллер, Андре С .; Кинг, Ф. Джеймс; Ли, Цзюнь; Жирарди, Энрико; Мбоу, М. Ламин; Уайтхерст, Чарльз Э .; Ребсамен, Мануэле; Суперти-Фурга, Джулио (13 мая 2020 г.). «TASL - это связанный с SLC15A4 адаптер для активации IRF5 с помощью TLR7–9». Природа. 581 (7808): 316–322. Bibcode:2020Натура.581..316H. Дои:10.1038 / s41586-020-2282-0. PMID 32433612. S2CID 218625265.

[7] Лю С., Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен Х, Ли Т, Ду Ф, Рен Дж, Ву И, Гришин Н. и Чен З. Дж. (13 марта 2015 г.). «Фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF вызывает активацию IRF3». Наука. 347 (6227): ааа2630. Дои:10.1126 / science.aaa2630. PMID 25636800.

[pmid21240265-8] Краусгрубер Т., Блазек К., Смолли Т., Альзабин С., Локстон Х., Сахгал Н., Хасселл Т., Фельдманн М., Удалова И.А. (январь 2011 г.). «IRF5 способствует поляризации воспалительных макрофагов и ответов T (H) 1-T (H) 17». Нат Иммунол. 12 (3): 231–238. Дои:10.1038 / ni.1990. PMID 21240265. S2CID 13730047. Сложить резюме – MedScape.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Navigation