WikiDer > KLF5

KLF5
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2EBT
Идентификаторы
Псевдонимы	KLF5, BTEB2, CKLF, IKLF, Kruppel-подобный фактор 5 (кишечник), Kruppel-подобный фактор 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602903 MGI: 1338056 ГомолоГен: 37520 Генные карты: KLF5
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 13 (человек)
Конец	73,077,541 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание ионов металлов; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание нуклеиновой кислоты; • последовательное связывание ДНК; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции; • Привязка MRF;
Сотовый компонент	• аппарат Гольджи; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • нуклеоплазма; • ядро клетки; • комплекс регуляторов транскрипции;
Биологический процесс	• регулирование сборки микроворсинок; • сборка микроворсинок; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие кишечных эпителиальных клеток; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • ангиогенез; • дифференциация клеток скелетных мышц; • положительное регулирование дифференцировки жировых клеток; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • клеточный ответ на органическое циклическое соединение; • положительное регулирование пролиферации клеток; • клеточный ответ на пептид; • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии; • передача сигналов между клетками через экзосомы; • положительная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция экспрессии генов; • дифференцировка сателлитных клеток скелетных мышц; • активация сателлитных клеток, участвующих в регенерации скелетных мышц; • дифференцировка миотрубок, участвующих в регенерации скелетных мышц; • регенерация ткани скелетных мышц; • положительная регуляция транскрипции за счет локализации транскрипционного фактора;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	688
	12224
	ENSG00000102554
	ENSMUSG00000005148
	Q13887
	Q9Z0Z7
	NM_001730; NM_001286818
	NM_009769
	NP_001273747; NP_001721
	NP_033899
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

KLF5

Фактор Круппеля 5 это белок что у людей кодируется KLF5 ген.^[4]^[5]

Функция

Этот ген кодирует член подсемейства Kruppel-подобных факторов белков цинкового пальца. Поскольку белок локализуется в ядре и связывает элемент ответа эпидермального фактора роста, считается, что он является фактор транскрипции.^[5]

Взаимодействия

KLF5 был показан взаимодействовать с участием Белковый НАБОР.^[6]

Смотрите также

Факторы типа Круппеля

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102554 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Согава К., Иматака Х., Ямасаки Й., Кусумэ Х., Абэ Х., Фудзи-Курияма Й. (апрель 1993 г.). «Клонирование кДНК и транскрипционные свойства нового связывающего GC бокса белка, BTEB2». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (7): 1527–32. Дои:10.1093 / nar / 21.7.1527. ЧВК 309358. PMID 8479902.
^ ^а ^б «Ген Entrez: KLF5 Kruppel-подобный фактор 5 (кишечник)».
^ Миямото С., Сузуки Т., Муто С., Айзава К., Кимура А., Мизуно Ю., Нагино Т., Имаи Ю., Адачи Н., Хорикоши М., Нагай Р. (декабрь 2003 г.). «Положительная и отрицательная регуляция фактора транскрипции сердечно-сосудистой системы KLF5 с помощью p300 и онкогенного регулятора SET посредством взаимодействия и ацетилирования в ДНК-связывающем домене». Молекулярная и клеточная биология. 23 (23): 8528–41. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8528-8541.2003. ЧВК 262669. PMID 14612398.

дальнейшее чтение

Галеб А.М., Нандан М.О., Чанчевалап С., Далтон В.Б., Хисамуддин И.М., Ян В.В. (февраль 2005 г.). «Крюппель-подобные факторы 4 и 5: регуляторы инь и янь клеточной пролиферации». Клеточные исследования. 15 (2): 92–6. Дои:10.1038 / sj.cr.7290271. ЧВК 1317089. PMID 15740636.
Нагай Р., Сузуки Т., Айзава К., Шиндо Т., Манабэ И. (август 2005 г.). «Значение фактора транскрипции KLF5 в ремоделировании сердечно-сосудистой системы». Журнал тромбоза и гемостаза. 3 (8): 1569–76. Дои:10.1111 / j.1538-7836.2005.01366.x. PMID 16102021.
Макконнелл ББ, Галеб А.М., Нандан МО, Ян В.В. (июнь 2007 г.). «Разнообразные функции Krüppel-подобных факторов 4 и 5 в эпителиальной биологии и патобиологии». BioEssays. 29 (6): 549–57. Дои:10.1002 / bies.20581. ЧВК 2211634. PMID 17508399.
Кодзима С., Кобаяси А., Гото О, Окума Ю., Фуджи-Курияма Ю., Согава К. (февраль 1997 г.). «Транскрипционный домен активации BTEB2 человека, фактор связывания GC бокса». Журнал биохимии. 121 (2): 389–96. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021600. PMID 9089417.
Conkright MD, Wani MA, Anderson KP, Lingrel JB (март 1999 г.). «Ген, кодирующий обогащенный кишечником член семейства факторов Крюппеля, экспрессируемый в эпителиальных клетках кишечника». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (5): 1263–70. Дои:10.1093 / nar / 27.5.1263. ЧВК 148310. PMID 9973612.
Ши Х, Чжан З, Ван Х, Лю С., Дэн Коннектикут (декабрь 1999 г.). «Выделение и характеристика гена, кодирующего человеческий фактор Kruppel-подобный 5 (IKLF): связывание с CAAT / GT боксом промотора гена лактоферрина мыши». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (24): 4807–15. Дои:10.1093 / nar / 27.24.4807. ЧВК 148782. PMID 10572182.
Хосино Ю., Курабаяси М., Канда Т., Хасэгава А., Сакамото Х., Окамото Е., Ковасе К., Ватанабэ Н., Манабе И., Сузуки Т., Накано А., Такасе С., Уилкокс Дж. Н., Нагай Р. (ноябрь 2000 г.). «Регулируемая экспрессия фактора транскрипции BTEB2 в клетках гладкой мускулатуры сосудов: анализ профилей онтогенетической и патологической экспрессии показывает значение фактора, прогнозирующего рестеноз». Тираж. 102 (20): 2528–34. Дои:10.1161 / 01.cir.102.20.2528. PMID 11076828.
Sun R, Chen X, Yang VW (март 2001 г.). «Обогащенный кишечником Крюппель-подобный фактор (Крюппель-подобный фактор 5) является положительным регулятором клеточной пролиферации». Журнал биологической химии. 276 (10): 6897–900. Дои:10.1074 / jbc.C000870200. ЧВК 2268089. PMID 11152667.
Dang DT, Zhao W., Mahatan CS, Geiman DE, Yang VW (июль 2002 г.). «Противодействующие эффекты Krüppel-подобного фактора 4 (обогащенного кишечника Krüppel-подобного фактора) и Krüppel-подобного фактора 5 (кишечного обогащенного Krüppel-подобного фактора) на промотор гена Krüppel-подобного фактора 4». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (13): 2736–41. Дои:10.1093 / нар / gkf400. ЧВК 117055. PMID 12087155.
Синдо Т., Манабэ I, Фукусима Ю., Тобе К., Айзава К., Миямото С., Кавай-Ковасе К., Морияма Н., Имаи Ю., Каваками Х., Нисимацу Х., Ишикава Т., Судзуки Т., Морита Х, Маэмура К., Сата М, Хирата Ю., Комукай М., Кагечика Х., Кадоваки Т., Курабаяши М., Нагай Р. (август 2002 г.). «Krüppel-подобный фактор транскрипции цинкового пальца KLF5 / BTEB2 является мишенью для передачи сигналов ангиотензина II и важным регулятором ремоделирования сердечно-сосудистой системы». Природа Медицина. 8 (8): 856–63. Дои:10,1038 / нм 738. PMID 12101409. S2CID 34181151.
Sur I, Undén AB, Toftgård R (июнь 2002 г.). «Человеческий Krüppel-подобный фактор5 / KLF5: синергизм с факторами NF-kappaB / Rel и экспрессия в коже человека и волосяных фолликулах». Европейский журнал клеточной биологии. 81 (6): 323–34. Дои:10.1078/0171-9335-00257. PMID 12113473.
Chen C, Bhalala HV, Qiao H, Dong JT (сентябрь 2002 г.). «Возможная роль фактора транскрипции KLF5 в опухолевом супрессоре при раке груди человека». Онкоген. 21 (43): 6567–72. Дои:10.1038 / sj.onc.1205817. PMID 12242654.
Ян XO, Doty RT, Hicks JS, Willerford DM (июнь 2003 г.). «Регулирование промотора Т-клеточного рецептора D beta 1 с помощью KLF5 посредством повторяющихся GC-богатых мотивов». Кровь. 101 (11): 4492–9. Дои:10.1182 / кровь-2002-08-2579. PMID 12576331.
Чен С., Бхалала Х.В., Веселла Р.Л., Донг Дж.Т. (май 2003 г.). «KLF5 часто удаляется и подавляется, но редко мутирует при раке простаты». Простаты. 55 (2): 81–8. Дои:10.1002 / pros.10205. PMID 12661032.
Zhang Z, Teng CT (апрель 2003 г.). «Фосфорилирование Kruppel-подобного фактора 5 (KLF5 / IKLF) в области взаимодействия CBP усиливает его функцию трансактивации». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (8): 2196–208. Дои:10.1093 / нар / гкг310. ЧВК 153738. PMID 12682370.
Охниши С., Охнами С., Лауб Ф., Аоки К., Судзуки К., Канаи И., Хага К., Асака М., Рамирес Ф., Ёсида Т. (август 2003 г.). «Подавление и ингибирующий рост эффект Krüppel-подобного эпителиального транскрипционного фактора KLF4, но не KLF5, при раке мочевого пузыря». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 308 (2): 251–6. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01356-1. PMID 12901861.
Айзава К., Сузуки Т., Када Н., Исихара А., Кавай-Ковасе К., Мацумура Т., Сасаки К., Мунемаса И., Манабе И., Курабаяси М., Коллинз Т., Нагай Р. (январь 2004 г.). «Регулирование цепи тромбоцитарного фактора роста-A с помощью Krüppel-подобного фактора 5: новый путь кооперативной активации с ядерным фактором-kappaB». Журнал биологической химии. 279 (1): 70–6. Дои:10.1074 / jbc.M306621200. PMID 14573617.
Сато Т., Канда Т., Иида Т., Такахаши Т., Киши С., Хосино Ю. (2004). «Иммуногистохимическое исследование хирургически вырезанных хориоидальных неоваскулярных мембран». Журнал международных медицинских исследований. 31 (5): 402–6. Дои:10.1177/147323000303100507. PMID 14587307. S2CID 33670045.

внешние ссылки

KLF5 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 13 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102554 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8479902-4] Согава К., Иматака Х., Ямасаки Й., Кусумэ Х., Абэ Х., Фудзи-Курияма Й. (апрель 1993 г.). «Клонирование кДНК и транскрипционные свойства нового связывающего GC бокса белка, BTEB2». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (7): 1527–32. Дои:10.1093 / nar / 21.7.1527. ЧВК 309358. PMID 8479902.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: KLF5 Kruppel-подобный фактор 5 (кишечник)».

[pmid14612398-6] Миямото С., Сузуки Т., Муто С., Айзава К., Кимура А., Мизуно Ю., Нагино Т., Имаи Ю., Адачи Н., Хорикоши М., Нагай Р. (декабрь 2003 г.). «Положительная и отрицательная регуляция фактора транскрипции сердечно-сосудистой системы KLF5 с помощью p300 и онкогенного регулятора SET посредством взаимодействия и ацетилирования в ДНК-связывающем домене». Молекулярная и клеточная биология. 23 (23): 8528–41. Дои:10.1128 / MCB.23.23.8528-8541.2003. ЧВК 262669. PMID 14612398.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Navigation